共聚焦扫描模式参数对照表

来源:共聚焦项目需求分析文档,6种扫描模式的功能参数与硬件控制逻辑的对照关系表。

概述

本文件定义了共聚焦显微镜操作软件支持的 6 种扫描模式,以及每种模式下的功能参数、对应的硬件控制逻辑和备注说明。表格采用四列结构:

列含义
A列扫描方式(模式名称)
B列功能与参数(软件侧参数)
C列对应硬件控制逻辑(硬件侧实现)
D列备注说明

六种扫描模式总览

序号扫描模式特有参数数核心特性
1XY 扫描5 个通用参数基础二维平面扫描
2XYZ 扫描4 个 Z 轴参数 + 5 个通用参数三维断层扫描(Z-stack)
3XYT 扫描2 个时间参数 + 5 个通用参数时间序列扫描(Time-lapse)
4XYλ 光谱扫描5 个光谱参数 + 5 个通用参数光谱成像(Lambda scan)
5大图拼接5 个位置参数 + 图像拼接 + 5 个通用参数大视场拼接成像(Mosaic)
6多点扫描5 个位置参数 + 5 个通用参数多 ROI 定点扫描

通用参数(所有模式均包含)

除特有参数外,每种扫描模式都包含以下 5 个通用功能参数:

功能参数对应硬件控制逻辑说明
帧频率振镜扫描控制扫描帧速率控制
通道选择激光器选择配置 / PMT 选择配置双通道配置:激光通道 + 检测通道
结果保存路径—数据存储路径设置
开始扫描接收返回数据并展示扫描启动与数据回显

各模式详细参数

1. XY 扫描

最基础的二维平面扫描模式。

功能参数对应硬件控制逻辑备注
帧频率振镜扫描控制
通道选择激光器选择配置
(通道选择续)PMT 选择配置
结果保存路径—
开始扫描接收返回数据并展示

2. XYZ 扫描(Z-stack)

三维断层扫描,沿 Z 轴逐层采集。

功能参数对应硬件控制逻辑备注
z轴起点设置Z轴起始位置
z轴终点设置Z轴终点位置
切片数层数,与步长相匹配层数 = 总厚度 / 步长
步长单层距离,与层数匹配相邻两层之间的距离
激光强度自适应调节与位置有关深度越深,激光强度可能需要增加以补偿衰减
帧频率振镜扫描控制通用参数
通道选择激光器选择配置 / PMT选择配置通用参数
结果保存路径—通用参数
开始扫描接收返回数据并展示通用参数

关键设计点:

  • 切片数(层数)与步长相互约束,必须匹配(总厚度 = 层数 × 步长)
  • 激光强度自适应调节与 Z 位置相关——深层样品荧光衰减需要补偿

3. XYT 扫描(Time-lapse)

时间序列扫描,在同一位置反复采集。

功能参数对应硬件控制逻辑备注
扫描间隔—完成一次XY扫描与下一次之间的间隔
扫描时长—完成周期(总实验时长)
帧频率振镜扫描控制通用参数
通道选择激光器选择配置 / PMT选择配置通用参数
结果保存路径—通用参数
开始扫描接收返回数据并展示通用参数

关键设计点:

  • 扫描间隔 = 两次扫描之间的等待时间
  • 扫描时长 = 整个时间序列实验的总周期

4. XYλ 光谱扫描

光谱成像,采集不同波长下的荧光信号。

功能参数对应硬件控制逻辑备注
起始波长—光谱扫描起始波长
终止波长—光谱扫描终止波长
光谱宽度—光谱采集范围(终止 - 起始)
扫描步长—从上一个波长到下一个波长之间的间隔
λ光谱步长—光谱分辨率步长
帧频率振镜扫描控制通用参数
通道选择激光器选择配置 / PMT选择配置通用参数
结果保存路径—通用参数
开始扫描接收返回数据并展示通用参数

关键设计点:

  • 包含”扫描步长”和”λ光谱步长”两个参数,可能分别指空间扫描步长和光谱扫描步长
  • 光谱扫描需要光谱分光器件(如光栅、声光可调滤光器等)支持

5. 大图拼接(Mosaic / Tile Scan)

大视场成像,通过移动位移台拍摄多个视场后拼接成大图。

功能参数对应硬件控制逻辑备注
扫描序号—第几个 tile
扫描x位置—当前 tile 的 X 坐标
扫描长度—X 方向范围
扫描y位置—当前 tile 的 Y 坐标
扫描宽度—Y 方向范围
帧频率振镜扫描控制通用参数
通道选择激光器选择配置 / PMT选择配置通用参数
结果保存路径—通用参数
开始扫描接收返回数据并展示通用参数
图像拼接—拼接算法

关键设计点:

  • 需要位移台精确控制位置(扫描x位置 / 扫描y位置)
  • 每个 tile 的扫描长度和宽度定义了单帧视场
  • 图像拼接作为独立步骤,有专门的拼接算法

6. 多点扫描(Multi-position / ROI Scan)

多个感兴趣区域(ROI)的定点扫描。

功能参数对应硬件控制逻辑备注
扫描序号—第几个点/ROI(注意:表格中出现两次”扫描序号”,可能一处为冗余或错误)
扫描x位置—ROI 的 X 坐标
扫描长度—X 方向范围
扫描y位置—ROI 的 Y 坐标
扫描宽度—Y 方向范围
帧频率振镜扫描控制通用参数
通道选择激光器选择配置 / PMT选择配置通用参数
结果保存路径—通用参数
开始扫描接收返回数据并展示通用参数

关键设计点:

  • 与大图拼接类似,都需要位移台定位,但多点扫描不需要拼接
  • 表格中第45行和第46行均为”扫描序号”,可能为录入错误,需确认

硬件控制逻辑汇总

软件功能参数到硬件控制的映射:

硬件模块对应的软件参数说明
振镜扫描控制帧频率控制 XY 扫描振镜的扫描速率
激光器选择配置通道选择选择激发激光器波长/开关
PMT 选择配置通道选择(第二行)选择光电倍增管检测通道
Z 轴起始位置z轴起点设置Z 轴位移台定位
Z 轴终点位置z轴终点设置Z 轴位移台定位
层数(与步长相匹配)切片数Z-stack 层数计算
单层距离(与层数匹配)步长Z 轴步进精度
与位置有关激光强度自适应调节AOTF 或激光功率随深度调节
接收返回数据并展示开始扫描数据采集与实时显示

关联笔记