Leica TCS SP5 激光共聚焦显微镜系统软件操作手册
徕卡 TCS SP5 激光共聚焦显微镜软件操作的中文精简手册,覆盖日常最常用的 4 种成像模式操作流程。
一、软件默认状态
打开软件后,默认进入 Acquire 面板的 acquisition 模式:
| 参数 | 默认值 |
|---|---|
| Acquisition mode | xyz(层面扫描) |
| Format 扫描像素 | 512×512 |
| Average | line and frame average 均为 1 |
常用扫描模式:
- xyz — 层面扫描(单张/多层)
- xyt — 时间扫描(时间序列)
- xyλ — 光谱扫描
推荐设置:
- 扫描像素:一般选 1024×1024
- 平均:一般选择 line average 2-3 次
二、图像保存方法
一般在扫描结束后统一保存;为防止数据丢失,也可从获取第一张图片开始,每获取一张保存一次。
方法 1:保存为 Leica .lif 格式(原始数据)
进入 Acquire 面板的 Experiment 中 → 右键点击 Experiment → 选择 “Save Experiment as…” → 保存 .lif 文件到指定文件夹并命名。
方法 2:导出为 TIFF 格式
- 单通道图片:右键点击 Experiment → 选择 “Export Experiment as tiff” → 选择目标文件夹 → 选中 rawdata 导出单通道图片
- 多通道合成图(overlay):再次右键点击 Experiment → 选择 “Export Experiment as tiff” → 选择目标文件夹 → 选中 overlay 导出合成图片
三、操作流程
1. 获取单一荧光图像
- 在 beam path setting 的 load/save single setting 中选择对应荧光的光路设置
- 点击 live 开始连续扫描,优化图像质量:
- 调节 z position 选择扫描层面
- 调节 gain 和 offset 使图像亮度和背景达到合适状态
- Zoom 调节电子放大倍率
- 点击 stop 停止扫描
- 选择像素 1024×1024
- 点击 capture image 获取图像
- 保存图像
2. 获取多荧光图像(序列扫描)
- 点击 seq,出现 sequential scan 面板
- 在 sequential scan 面板中点击 scan 1 → 在 beam path setting 中选择第一种荧光光路设置
- 点击 live 优化图像质量(z position / gain / offset / Zoom)
- 点击 stop 停止
- 点击 ”+” 添加 scan 2 → 选择第二种荧光光路设置 → 同样优化质量
- 标记了几种荧光就添加几种方法
- 选择 “between frames” 模式(帧间切换,减少串色)
- 选择像素 1024×1024 → 点击 Start 获取图像
- 保存图像
3. 获取多层荧光图像(Z-Stack)
- 在 beam path setting 中选择荧光光路设置
- 打开 Z-stack 面板
- 点击 live 开始连续扫描:
- 调节 z position 选择扫描层面
- 设置 begin 和 end(扫描起止位置)
- 调节 gain 和 offset / Zoom
- 点击 stop 停止扫描
- 在 Z-stack 面板中确定 Nr. Of steps(需扫描的张数/步数)
- 点击 start 获取图像
- 如需叠加:Process 面板 → 选择 visualization → 3D projection → 点击 apply 生成叠加图像
- 保存图像
4. 获取时间序列图像
- Acquisition mode 改为 xyt
- 根据时间间隔和图像质量要求,调整 format 和 line average 值
- 在 beam path setting 的 load/save single setting 中选择荧光光路设置
- 多种荧光则点击 seq 设置序列扫描
- 点击 live 优化图像质量(z position / gain / offset / Zoom)→ stop
- 点击 start 获取图像
- 保存图像
四、关键概念速查
| 术语 | 含义 |
|---|---|
| beam path setting | 光路设置,决定激发/发射波长配置 |
| gain / offset | 增益/偏移,调节图像亮度与背景 |
| Zoom | 电子放大倍率,通过缩小扫描范围实现 |
| line average | 行平均,提高图像质量(降噪) |
| sequential scan | 序列扫描,多荧光时逐通道扫描减少串色 |
| between frames | 帧间切换模式,多色序列扫描的一种时序 |
| Z-stack / Nr. Of steps | Z轴层扫 / 步数(张数) |
| .lif | 徕卡原始数据格式,含多通道/多层/时间序列完整信息 |
| 3D projection | 3D 投影,Z-stack 叠加生成二维图像 |
关联笔记
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