Aperio ImageScope 用户指南
徕卡生物系统（Leica Biosystems）旗下 Aperio 品牌的数字病理切片（eSlide）查看软件，支持全切片扫描图像的浏览、标注、分析、会议协作与远程实时查看。
注意：本软件供研究使用，不得用于诊断程序（For research use only. Not for use in diagnostic procedures.）。
一、产品概览
1.1 核心定位
- 厂商：Leica Biosystems Imaging, Inc.（Aperio 品牌）
- 产品家族：Aperio ePathology 数字病理产品线
- 配套服务端：Aperio eSlide Manager + Aperio ImageServer
- 配套扫描仪：Aperio 系列扫描仪（含 FL 荧光扫描仪）
1.2 核心功能（12 大能力）
| 能力 | 说明 |
|---|
| 网络化查看 | 从任意联网工作站浏览 eSlide，无需物理搬运玻璃切片 |
| 多片同览 | 同时打开多个 eSlide，支持 filmstrip 胶片条切换 |
| 实时会议 | eSlide Conferencing — 多人远程同步浏览+标注 |
| 图像调整 | 亮度/对比度/伽马/色彩平衡/色彩曲线调节 |
| 算法分析 | 对整张切片或选定区域运行图像分析算法 |
| Z-Stack | 查看和分析多层聚焦扫描图像 |
| TelePath Live | 直连扫描仪实时查看，支持多层采集 |
| 旋转功能 | 图像和标签旋转（8 种方向） |
| 色彩管理 | Aperio Integrated Color Management，ICC Profile 支持 |
| IQ 图像质量 | 根据染色类型优化显示效果 |
| 标注系统 | 多种标注工具+图层管理+属性+链接 |
| 区域导出 | 提取感兴趣区域，支持多种格式输出 |
1.3 支持的文件类型
- Aperio 扫描的 eSlide（SVS 格式等）
- 本地图像文件（BMP/JPEG/PNG/TIFF 等）
- ScanScope Image Sets (.sis) — 保存的视图配置
- Aperio Fused Image (AFI) — 荧光融合图像
- Composite WebSlide (CWS) 格式
二、界面与导航
2.1 主窗口布局
┌─────────────── 工具栏 (Toolbar) ───────────────┐
│ Filmstrip（胶片条） │ 主视图窗口 │ 缩略图(Thumbnail) │
│ 标签窗口(Label) │ │ 放大镜(Magnifier) │
├─────────────── 状态栏 (Status bar) ─────────────┤
│ 缩放滑块 Zoom slider / 聚焦滑块 Focus slider（Z-Stack）│
└────────────────────────────────────────────────┘
2.2 导航方式
| 操作 | 方式 |
|---|
| 平移（Panning） | 鼠标拖拽 / 方向键微移 / Shift+方向键整屏移动 |
| 缩放 | 缩放滑块 / Ctrl+Plus/Minus / 鼠标滚轮 |
| 缩略图导航 | 缩略图窗口中点击目标区域 |
| 放大镜窗口 | 对指定区域做局部放大 |
| 多片同步 | Smart Sync 智能同步 + 手动同步 |
2.3 多 eSlide 管理
- Filmstrip 胶片条：已打开的切片以缩略图横向排列
- Keep Open 选项：锁定当前图像不被替换
- Image View 保存：将当前多片布局+缩放+平移保存为
.sis 文件，下次一键恢复
- 关闭确认：有未保存标注时提示保存
三、图像调整
3.1 调节维度
- 亮度 / 对比度 / 伽马 — 全通道或单独 R/G/B 通道
- 色彩平衡 — 偏色校正（如红色→青色偏移）
- 色彩曲线 — 自定义曲线映射
- 主图像 / Z-Stack 图像 分别调节
3.2 重要特性
- 调整仅作用于当前会话，不修改原始 eSlide
- 可保存为 Gamma Table 文件（.gamma），下次重新加载
- 支持保存快照（Snapshot）导出调整后的图像
- 荧光图像有独立的融合调节窗口（见第七章）
四、荧光 eSlide（Fluorescence）
4.1 荧光图像来源
- Aperio FL 扫描仪产生的图像为灰度图，扫描时做伪彩色处理
- ImageScope 支持完整的荧光图像后处理流程
4.2 荧光操作功能
| 功能 | 说明 |
|---|
| 临时伪彩色 | 对灰度荧光图应用临时假色（当前会话有效） |
| 通道颜色 | 修改融合图像中各通道的显示颜色 |
| 亮度/对比度/伽马 | 带直方图实时预览，逐通道调节 |
| 配准调整 | 调整各通道间的配准（Registration） |
| 多通道融合 | 自动（AFI）或手动融合多通道荧光图像 |
| 通道切换 | 循环显示/查看全部单通道图像 |
| 强度直方图 | Intensity Histogram 可视化分布 |
4.3 AFI（Aperio Fused Image）
- Aperio 扫描仪采集时自动生成的融合图像
- 在 Fusion Adjustments 窗口中的修改会随图像保存
- 支持重新生成 AFI（Create AFI）
五、标注系统（Annotations）
5.1 标注工具一览
| 工具 | 快捷键 | 用途 |
|---|
| Pen（画笔） | F2 | 自由手绘 |
| Negative Pen（负画笔） | F3 | 擦除手绘区域 |
| Ruler（标尺） | F4 | 距离测量 |
| Rectangle（矩形） | F5 | 矩形标注 |
| Ellipse（椭圆） | F6 | 椭圆标注 |
| Arrow（箭头） | F7 | 箭头标注 |
| Counter（计数点） | F9 | 细胞/目标计数 |
5.2 高级标注技巧
- 固定尺寸：按住 Ctrl 绘制 → 使用预定义尺寸
- 固定比例：按住 Shift 绘制 → 椭圆变圆 / 矩形变方
- 自由手绘编辑：可添加/删除节点，修复问题区域
- Z-Stack 标注：在多层图像上标注
- 移动全部标注：Ctrl+Shift 组合键
5.3 标注窗口（Annotations Window）
两种模式：
- Summary View（摘要视图）：专为 eIHC（免疫组化）设计，一步式标注+分析，适合病理学家工作流
- Detailed View（详细视图）：完整标注管理，支持图层、属性、文本标签等
5.4 标注图层与属性
- 分层管理（类似 Photoshop 图层概念）
- 支持导入/导出标注图层
- 可添加自定义属性（Attributes）（名称/值对）
- 算法分析结果也存储在标注图层中
- 长度与面积实时显示
5.5 标注链接（Annotation Linking）
- Link Manager 管理标注间的浏览顺序
- 类似幻灯片播放，按定义顺序跳转
- 用于教学、汇报、病例展示
六、保存与导出
6.1 保存方式
| 方式 | 用途 | 格式 |
|---|
| Snapshot（快照） | 当前视图截图，可邮件发送 | 图片格式 |
| Copy & Paste | 复制当前视图到剪贴板 | - |
| Extract Region（区域提取） | 提取选定区域的高分辨率图像 | BMP/JPEG/PNG/TIFF 等 |
| Save Image View | 保存多片布局+视图状态 | .sis |
| 特定尺寸导出 | 输出指定像素尺寸的图像 | 多种格式 |
6.2 区域提取要点
- 支持提取单个或多个选定区域
- 支持预定义尺寸或宽高比
- 荧光多通道 SCN eSlide 可提取感兴趣区域
- 有进度条显示提取状态
七、eSlide 会议（Conferencing）
7.1 功能定位
多人远程同步浏览同一张数字切片，类似屏幕共享但更高清、更低延迟、可交互。
7.2 核心概念
- Leader（主持者）：创建会议，控制视图
- Follower（参与者）：跟随 Leader 的视图和标注
- DSC Server：Digital Slide Conferencing 服务器（通常 80 端口）
- 所有参与者需安装 ImageScope + 可访问同一 ImageServer/网络共享
7.3 会议功能
- 同步视图（所有人看到同一区域）
- 实时标注共享
- 主持人切换（Leader ↔ Follower 角色互换）
- 会议创建者可重新夺回主持权
八、TelePath Live（实时扫描）
8.1 功能定位
通过网络直连 Aperio 扫描仪，实时查看扫描中的玻片，支持多层聚焦采集（Z-Stack）。
8.2 关键能力
- 实时视频流查看扫描仪视野
- Z-Stack 采集（定义起止范围+步长+层数）
- Z-Stack 查看（聚焦滑块切换层）
- 校准功能
- 支持多种 Aperio 扫描仪型号
8.3 Z-Stack 概念
同一位置不同焦平面的多张图像堆叠，模拟 3D 景深效果。用于：
- 厚切片/细胞学样本观察
- 聚焦不准时的事后对焦
- 3D 结构分析
九、图像质量（IQ）
IQ（Image Quality）功能根据切片的染色类型自动优化显示效果：
- 预设多种染色模式
- 一键切换优化视图
- 快捷键：Ctrl+Q 开关
十、工具与诊断
| 工具 | 用途 |
|---|
| 日志（Logging） | Ctrl+L 开关，记录操作日志用于排错 |
| 缓存显示（Cache Display） | 查看图像缓存加载状态 |
| 多会话运行 | 可同时开启多个 ImageScope 实例 |
| 统计信息 | 性能统计数据 |
| 最大缓存大小 | 可调，影响大图像浏览流畅度 |
十一、选项设置（Options）
| 分类 | 关键设置项 |
|---|
| 常规 | 默认放大倍率、默认伽马表 |
| 分析 | 算法分析相关参数 |
| 导航 | 同步选项、平移选项 |
| 标注 | 颜色、固定尺寸、自动保存 |
| 跟踪 | Tracking 选项 |
| 性能 | 像素平滑、渐进渲染、插值（3D 图像） |
| HTTP 代理 | 远程访问代理设置 |
| 报告图像 | 报告生成相关 |
| 色彩管理 | ICC Profile 配置 |
| 邮件 | 快照邮件发送设置 |
十二、色彩管理（Color Management）
- 基于 ICC Profile 的集成色彩管理
- 扫描仪 ICC Profile：确保采集端色彩准确
- 显示器 ICC Profile：确保显示端色彩还原
- 保证不同设备间色彩一致性
- 快捷键：Ctrl+B 开关集成色彩管理
附录 A：常用快捷键速查
视图操作
| 快捷键 | 功能 |
|---|
| 方向键 | 微移图像 |
| Shift+方向键 | 整屏移动 |
| Ctrl + Plus/Minus | 放大/缩小 |
| Ctrl+T | 显示/隐藏缩略图 |
| Ctrl+E | 旋转图像工具栏 |
| Ctrl+Q | IQ 图像质量开关 |
| Ctrl+B | 色彩管理开关 |
| F11 | 全屏视图 |
文件操作
| 快捷键 | 功能 |
|---|
| Ctrl+O | 打开本地图像 |
| Ctrl+R | 连接远程服务器 |
| Ctrl+F4 | 关闭当前图像 |
| Ctrl+A | 图像调整窗口 |
标注工具
| 快捷键 | 功能 |
|---|
| F2 | 画笔工具 |
| F3 | 负画笔 |
| F4 | 标尺工具 |
| F5 | 矩形工具 |
| F6 | 椭圆工具 |
| F7 | 箭头工具 |
| F9 | 计数工具 |
| Ctrl+N | 标注窗口 |
| F8 | 标注链接管理器 |
其他
| 快捷键 | 功能 |
|---|
| Ctrl+D | 数字切片会议 |
| Ctrl+G | 运行算法分析 |
| Ctrl+L | 日志开关 |
| Ctrl+K | Keep Open 开关 |
| Ctrl+F | 图像预取开关 |
| Ctrl+P | 选项设置 |
| F1 | 帮助 |
| Ctrl+C | 复制（有标注选中标注，无选中标注则复制视图） |
相关笔记
备注
- 文件名
Lecia_mageScope_User_Guide.pdf 中的 “Lecia” 为拼写错误，正确拼写为 Leica
- 文件名中的 “mageScope” 缺少首字母 I，完整名为 ImageScope
- 本软件属于 Aperio ePathology 产品线，与徕卡显微系统（Leica Microsystems）的共聚焦显微镜分属不同业务集团（Leica Biosystems vs Leica Microsystems）