寻峰算法-96孔QPCR荧光扫描原始数据与孔位定位

文件实为96孔QPCR仪6通道荧光扫描原始数据与孔位定位表,用于寻峰算法验证,而非算法说明文档。

文件概览

  • 格式:XLSX,17个Sheet,4.07MB
  • 来源:/工作相关/QPCR(1)/02 数据整理/寻峰算法.xlsx
  • 内容结构:
    • 6个孔位定位Sheet(FAM/HEX/CY5/TAMRA/ROX/CY5.5)
    • 10个原始扫描数据Sheet(27054个采样点/孔)
    • 1个Sheet为双通道数据(D5 H9 B12)

核心工程参数

孔位间距

  • 统一值:28(单位:扫描采样点索引)
  • 所有6个通道孔位间距完全一致,说明机械扫描精度稳定

96孔板定位索引表

各通道在扫描数据中的孔位起始索引(A1为第1行第1列,H12为第8行第12列):

通道A1位置H1位置A12位置H12位置列间距(A→B)行间距(1→2)
FAM86444605564152~897-28
HEX22630261572293826465~520+28
CY55426891551188607~788-28
TAMRA990913450960113142~536+28
ROX18177215921848521900~407-28
CY5.513645171141395317422~463+28

注:行间距正负反映扫描方向(从上往下扫描时行号减小则索引增大)。列间距差异反映各通道在光学路径中的相对位移。

通道排布规律

  1. 6个荧光通道独立扫描,每个通道有独立的孔位坐标体系
  2. 孔位编号规则:列A-H(8列),行1-12(12行),共96孔
  3. 定位表结构:8列×12行 = 96孔,每个单元格存该孔中心在扫描序列中的索引值
  4. 生成方式:HEX/CY5/TAMRA/ROX/CY5.5 用公式 ±28 生成,FAM为基础数据(无公式)

原始数据特征

  • 采样点数:每孔约 27054 个采样点
  • 数据维度:单通道单列为一列数值,双通道为两列
  • 基线值:约 380-420(无荧光时的背景噪声水平)
  • 峰值水平:从数据看样本孔峰值约 460-500(增幅约 15-25%)
  • 数据用途:用于验证寻峰算法对96孔板扫描信号中各个孔峰位的准确识别

包含的Sheet清单

孔位定位表(6个)

  1. 96孔FAM定位
  2. 96孔HEX定位
  3. 96孔CY5定位
  4. 96孔TAMRA定位
  5. 96孔ROX定位
  6. 96孔CY55定位(CY5.5)

原始扫描数据(10个)

  1. Sheet1(单孔FAM通道数据)
  2. D5 F9 C9(D5孔FAM?单通道)
  3. Sheet5
  4. E5 H9 F9(E5孔HEX?单通道)
  5. Sheet2
  6. H3 C6 C9(H3孔CY5?单通道)
  7. Sheet3
  8. D5 H9 B12(D5/H9双通道数据,2列)
  9. Sheet6
  10. H3 E1 C6(H3孔ROX?单通道)
  11. Sheet4

命名格式”X Y Z”为3个孔位编号,每个Sheet实际存1-2列数据,推测是不同孔位的扫描曲线用于算法验证。

工程价值

  1. 孔位校准数据:6通道96孔完整定位索引,是仪器光学系统校准的直接产物
  2. 通道间位移:各通道起始位置差异反映了多通道分光系统的物理布局
  3. 算法验证数据:原始扫描数据用于开发和验证荧光信号寻峰算法
  4. 基线参考:基线值~390可为系统噪声评估提供参考

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