QPCR 项目原始数据矩阵(02 数据整理)

来源:云盘 /工作相关/QPCR(1)/02 数据整理/原始数据.xlsx。无表头、无元数据的裸数据矩阵,是当年 QPCR 项目数据整理环节留下的仪器原始输出。笔记记录数据形态与统计特征,供后续复现数据处理流程时对照。

数据形态

  • 单工作表 Sheet1,27054 行 × 39 列,全部为整数,无任何文本/表头单元格
  • 数值范围 0–8388,量级特征符合 13-bit ADC 计数(满量程 8192 附近,个别值略超,或为累加/增益后计数)
  • 列均值从 col1 的 1476.7 单调缓升到 col37 的 1494.9——列为 39 个并行通道/泳道/波长切片,随通道位置有轻微系统性漂移

行方向(扫描序)特征

  • 前段(行 1–1000):col1 稳定在 320–345 的基线带
  • 行 5001 附近基线降到 ~167(信号低谷或漂移段)
  • 行 9595 起出现 >5000 的高值段(col1>5000 共 985 行,集中在 9595–9660 等连续区段)——明显的峰团
  • 行 15001 附近 col1 ≈ 2414 的次强区
  • 尾段(行 20000+)回落到 430–820
  • col1 有 143 个 0 值(归零/坏点标记)

判读

  • 形态上是”多通道 × 连续扫描点”的原始谱图/电泳剖面数据,而不是 QPCR 扩增曲线(扩增曲线是几十~上百循环的 S 型,这里是 2.7 万点连续剖面)
  • 与 /工作相关/ 中质谱峰检测、重叠色谱峰解析等工作文档同属一个时期的仪器数据积累(关联 便携式质谱重叠峰解析-小波变换vs分形理论、质谱峰检测模拟数据);推测为毛细管电泳/质谱多通道扫描原始输出,用于峰检测算法开发测试。具体仪器与采集参数云盘内无记录,待确认

可复用点

  • 峰检测算法的天然测试集:含平坦基线段、低谷段、强峰团(9595+)、次强峰(15000 区)与尾段回落,覆盖多种典型工况
  • 提取方式:openpyxl read_only 模式逐行 iter_rows(5.4MB xlsx 在树莓派上秒级加载)