HBV qPCR 引物对比实验-94-55-65度退火(2021-07-05)

来源:云盘 /工作相关/qpcr 参考/zcs/exp/乙肝/94-55-65度-HBV-20210705.xlsx。文件名即退火温度程序 94/55/65°C,是同日 94-60-65 度实验的姊妹组(见关联)。

实验设计

  • 96 孔板,FAM(HBV 目标基因)+ HEX(内源参照/内标)双通道
  • 第 7 列(B7-G7)为引物对比区,每孔单复孔排布:
    • B7/C7 = 引物1,D7/E7 = 引物4,F7/G7 = 引物文献(文献引物对照)
  • A5/A6/B5/B6/C5/C6 有低值 Ct(15.3-16.8),疑似阳性对照或污染监测孔(HEX 通道 15.3-16.8 段在内参列,数值异常偏低,待确认)

关键结果(FAM-HBV,第7行引物区)

孔位引物Ct
B7引物122.637
C7引物122.512
D7引物422.488
E7引物422.512
F7引物文献21.621
G7引物文献22.004
  • 三组引物 Ct 均在 21.6-22.6 区间,重复孔间差异 <0.4,组内重复性好
  • 文献引物 Ct 略低(21.6/22.0),扩增效率略优于自建引物1/引物4,但差异 <1 个循环,无显著劣势
  • 复孔 Ct 标准差 0(统计表单孔无重复统计意义)

数据结构(qPCR 结果导出格式参考)

  • 「结果」sheet:孔位/样本编号/样本名称/样本类型/荧光/目标基因/Ct/浓度/浓度单位/标准浓度/参比荧光/唯一性编号/重复组/QC
  • 「统计」sheet:按重复组聚合的 Ct 平均值/标准差/CV%、浓度及 Log 浓度的均值/标准差/CV%
  • 大量空白孔输出”待测/-/通过”占位行——软件导出时不过滤空孔

关联