寻峰算法-96孔QPCR荧光扫描原始数据与孔位定位
文件实为96孔QPCR仪6通道荧光扫描原始数据与孔位定位表,用于寻峰算法验证,而非算法说明文档。
文件概览
- 格式:XLSX,17个Sheet,4.07MB
- 来源:/工作相关/QPCR(1)/02 数据整理/寻峰算法.xlsx
- 内容结构:
- 6个孔位定位Sheet(FAM/HEX/CY5/TAMRA/ROX/CY5.5)
- 10个原始扫描数据Sheet(27054个采样点/孔)
- 1个Sheet为双通道数据(D5 H9 B12)
核心工程参数
孔位间距
- 统一值:28(单位:扫描采样点索引)
- 所有6个通道孔位间距完全一致,说明机械扫描精度稳定
96孔板定位索引表
各通道在扫描数据中的孔位起始索引(A1为第1行第1列,H12为第8行第12列):
| 通道 | A1位置 | H1位置 | A12位置 | H12位置 | 列间距(A→B) | 行间距(1→2) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| FAM | 864 | 4460 | 556 | 4152 | ~897 | -28 |
| HEX | 22630 | 26157 | 22938 | 26465 | ~520 | +28 |
| CY5 | 5426 | 8915 | 5118 | 8607 | ~788 | -28 |
| TAMRA | 9909 | 13450 | 9601 | 13142 | ~536 | +28 |
| ROX | 18177 | 21592 | 18485 | 21900 | ~407 | -28 |
| CY5.5 | 13645 | 17114 | 13953 | 17422 | ~463 | +28 |
注:行间距正负反映扫描方向(从上往下扫描时行号减小则索引增大)。列间距差异反映各通道在光学路径中的相对位移。
通道排布规律
- 6个荧光通道独立扫描,每个通道有独立的孔位坐标体系
- 孔位编号规则:列A-H(8列),行1-12(12行),共96孔
- 定位表结构:8列×12行 = 96孔,每个单元格存该孔中心在扫描序列中的索引值
- 生成方式:HEX/CY5/TAMRA/ROX/CY5.5 用公式
±28生成,FAM为基础数据(无公式)
原始数据特征
- 采样点数:每孔约 27054 个采样点
- 数据维度:单通道单列为一列数值,双通道为两列
- 基线值:约 380-420(无荧光时的背景噪声水平)
- 峰值水平:从数据看样本孔峰值约 460-500(增幅约 15-25%)
- 数据用途:用于验证寻峰算法对96孔板扫描信号中各个孔峰位的准确识别
包含的Sheet清单
孔位定位表(6个)
- 96孔FAM定位
- 96孔HEX定位
- 96孔CY5定位
- 96孔TAMRA定位
- 96孔ROX定位
- 96孔CY55定位(CY5.5)
原始扫描数据(10个)
- Sheet1(单孔FAM通道数据)
- D5 F9 C9(D5孔FAM?单通道)
- Sheet5
- E5 H9 F9(E5孔HEX?单通道)
- Sheet2
- H3 C6 C9(H3孔CY5?单通道)
- Sheet3
- D5 H9 B12(D5/H9双通道数据,2列)
- Sheet6
- H3 E1 C6(H3孔ROX?单通道)
- Sheet4
命名格式”X Y Z”为3个孔位编号,每个Sheet实际存1-2列数据,推测是不同孔位的扫描曲线用于算法验证。
工程价值
- 孔位校准数据:6通道96孔完整定位索引,是仪器光学系统校准的直接产物
- 通道间位移:各通道起始位置差异反映了多通道分光系统的物理布局
- 算法验证数据:原始扫描数据用于开发和验证荧光信号寻峰算法
- 基线参考:基线值~390可为系统噪声评估提供参考